Дисбактериоз практически всегда является вторичным состоянием, то есть возникает на фоне недостатка ферментов, неправильного питания, неграмотного лечения антибиотиками и пр. По этой причине пытаться вылечить дисбактериоз без выяснения и устранения его первичной причины это заведомо бесполезное занятие. в вашем случае причиной дисбактериоза и сопутствующих ему проблем действительно может быть ЛН. Вам следует отвезти ребенка к врачу который может назначить и провести все необходимые анализы (анализ по определению углеводов кала, копрограмма и пр.).
До проведения диагностики ЛН от лечения антибиотиками можно отказаться.